Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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