Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRKCHP24723 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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