Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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