Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.3 ms