Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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