Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.6 ms