Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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