Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt71Q9R0H5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms