Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl27Q99N92 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms