Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms