Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms