Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
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