Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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