Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CNN3Q15417 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CNN3Q15417 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CNN3Q15417 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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