Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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