Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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