Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXD4Q12950 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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