Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933402E13RikQ9D4D2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms