Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Knl1Q66JQ7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms