Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx7F8VPJ6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx7F8VPJ6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx7F8VPJ6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx7F8VPJ6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx7F8VPJ6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx7F8VPJ6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx7F8VPJ6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx7F8VPJ6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx7F8VPJ6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms