Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933424G06RikA0A140LIP3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms