Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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