Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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