Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms