Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms