Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms