Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd4b4J3QNS5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms