Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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