Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3aP28741 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms