Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx7F8VPJ6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms