Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsc22d3Q9Z2S7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tsc22d3Q9Z2S7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsc22d3Q9Z2S7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms