Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Uso1Q9Z1Z0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uso1Q9Z1Z0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Uso1Q9Z1Z0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uso1Q9Z1Z0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uso1Q9Z1Z0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms