Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Padi1Q9Z185 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Padi1Q9Z185 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Padi1Q9Z185 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Padi1Q9Z185 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms