Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1Q9Z179 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shcbp1Q9Z179 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shcbp1Q9Z179 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms