Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sumo3Q9Z172 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sumo3Q9Z172 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sumo3Q9Z172 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms