Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pf4Q9Z126 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pf4Q9Z126 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pf4Q9Z126 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pf4Q9Z126 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pf4Q9Z126 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms