Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dctn3Q9Z0Y1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dctn3Q9Z0Y1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dctn3Q9Z0Y1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dctn3Q9Z0Y1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dctn3Q9Z0Y1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dctn3Q9Z0Y1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dctn3Q9Z0Y1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms