Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms