Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cited4Q9WUL8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cited4Q9WUL8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cited4Q9WUL8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cited4Q9WUL8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.1 ms