Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lhx9Q9WUH2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx9Q9WUH2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx9Q9WUH2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx9Q9WUH2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx9Q9WUH2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lhx9Q9WUH2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx9Q9WUH2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx9Q9WUH2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lhx9Q9WUH2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lhx9Q9WUH2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lhx9Q9WUH2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lhx9Q9WUH2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lhx9Q9WUH2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms