Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scnn1gQ9WU39 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Scnn1gQ9WU39 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scnn1gQ9WU39 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scnn1gQ9WU39 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scnn1gQ9WU39 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scnn1gQ9WU39 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scnn1gQ9WU39 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scnn1gQ9WU39 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scnn1gQ9WU39 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Scnn1gQ9WU39 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scnn1gQ9WU39 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scnn1gQ9WU39 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scnn1gQ9WU39 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scnn1gQ9WU39 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scnn1gQ9WU39 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scnn1gQ9WU39 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms