Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cul1Q9WTX6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cul1Q9WTX6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul1Q9WTX6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cul1Q9WTX6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms