Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6cQ9WTM3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema6cQ9WTM3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6cQ9WTM3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6cQ9WTM3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6cQ9WTM3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6cQ9WTM3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6cQ9WTM3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6cQ9WTM3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6cQ9WTM3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6cQ9WTM3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6cQ9WTM3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6cQ9WTM3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6cQ9WTM3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6cQ9WTM3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema6cQ9WTM3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6cQ9WTM3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms