Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp6ap1Q9R1Q9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms