Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmed2Q9R0Q3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmed2Q9R0Q3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmed2Q9R0Q3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmed2Q9R0Q3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms