Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plod2Q9R0B9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod2Q9R0B9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Plod2Q9R0B9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod2Q9R0B9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms