Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BcamQ9R069 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BcamQ9R069 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BcamQ9R069 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BcamQ9R069 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms