Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp11cQ9QZW0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp11cQ9QZW0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp11cQ9QZW0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp11cQ9QZW0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp11cQ9QZW0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp11cQ9QZW0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms