Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vnn3Q9QZ25 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vnn3Q9QZ25 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vnn3Q9QZ25 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vnn3Q9QZ25 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vnn3Q9QZ25 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vnn3Q9QZ25 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vnn3Q9QZ25 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vnn3Q9QZ25 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vnn3Q9QZ25 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vnn3Q9QZ25 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vnn3Q9QZ25 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vnn3Q9QZ25 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vnn3Q9QZ25 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vnn3Q9QZ25 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vnn3Q9QZ25 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms