Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnckQ9QYK9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnckQ9QYK9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PnckQ9QYK9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PnckQ9QYK9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.2 ms