Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcsk1nQ9QXV0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcsk1nQ9QXV0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcsk1nQ9QXV0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms